L’isola di San Nicola è un vanto per l’Italia intera, al centro di una leggenda che sconfina nella storia: nel IV secolo d.C., un eremita ebbe una visione della Madonna che gli indicò il punto in cui scavare per trovare il tesoro di Diomede, e in poco tempo nacque il monastero che ancora oggi si può visitare. Benedettini, cistercensi e lateranensi si alternarono, abitando e difendendo questa abbazia fortificata.
La roccia si confonde con la pietra chiara con cui è costruita l’abbazia ed è soprattutto dal mare che si può apprezzare il colpo d’occhio di questo spettacolare unicum. San Nicola è un luogo magico, esercita il fascino e la suggestione di un’isola che è il centro storico e amministrativo dell’arcipelago ed è la più interessante, per quanto riguarda i resti monumentali: lì si trova la celebre fortezza-abbazia di Santa Maria a Mare, con fortificazioni, torri, muraglie, chiese e vari chiostri. Nei secoli è stata abitata dai Benedettini Cassinesi, dai Cistercensi e dai Canonici Lateranensi e utilizzata persino come colonia penale in epoca più recente. Oltre all’abbazia meritano una visita il Torrione del Cavaliere del Crocifisso e il Castello dei Badiali. Come tutte le isole Tremiti, anche San Nicola presenta un paesaggio molto interessante e suggestivo. Da segnalare la Grotta di San Michele, che assomiglia a un teschio (e dove le acque assumono un colore azzurro fosforescente) e gli Scogli Segati, ovvero un masso staccatosi dall’isola e spaccatosi in due nella caduta.
Le variazioni ad opera di erosione, sedimentazione e cambiamento del livello marino a San Nicola, sono assai spettacolari: sia le scarpate delle falesie che le dune ospitano una flora ed una fauna molto caratteristiche, che hanno permesso l’inclusione dell’intero arcipelago nel Parco nazionale del Gargano. Il mare attorno a San Nicola è caratterizzato da acque trasparenti, e dalla presenza di numerose grotte sottomarine, originatesi a inseguito di fenomeni di erosione della roccia calcarea.